Question

В чем различие в значениях слова завод в данных сочетаниях слов? Тракторныйзавод, завод у часов

Answer 1

В первом случае в плане завод , как производство , а во втором от слова завести

Answer 2

Здесь представлены омонимы - одинаково звучат и пишутся, но значение разное. 
В первом случае означает существительное предмет -"промышленное предприятие".
Во втором случае отглагольное существительное. То есть приспособление, которое нужно завести.