Question

Практична робота № 1

Розв'язування елементарних вправ зі структури білків і нуклеїнових кислот

Мета: навчитися застосовувати знання про будову білків і нуклеїнових кислот для розв'язування вправ.

Довідкова інформація: лінійна довжина одного амінокислотного залишку: (ак) = 0,35 нм; середня відносна молекулярна маса одного амінокислотного за- лишку: М(ак) = 110; лінійна довжина одного нуклеотида: 1(нк) = 0,34 нм; середня відносна молекулярна маса одного нуклеотида: М,(нк) = 345.

Хід роботи

Вправи та задачі про структуру білка

1 2 Відносна молекулярна маса білка м'язів міозину близько 500 000. Скільки амінокислотних залишків входить до складу його ланцюга?

Білок пепсин містить 340 амінокислотних залишків. Визначте масу й довжи ну білкового ланцюга цього ферменту.

Напишіть усі можливі послідовності амінокислотних ланцюгів довжиною у два залишки, що складаються з різних або однакових амінокислот <<А>>> 1 «Б», та підрахуйте їх кількість. Зробіть те саме з набором амінокислот <<<А>>, <<Б>> і <<В>>. Виведіть загальну формулу для визначення кількості ва- ріантів амінокислотних ланцюгів залежно від їхньої довжини (кількості за- лишків) та різноманітності амінокислот у їхньому складі.

Гормон росту соматотропін містить 9 залишків амінокислоти лізину з від- носною молекулярною масою 146. Яку відносну молекулярну масу має весь білок, якщо лізин становить всього 5,29% від його маси?

5 Яка кількість пептидних зв'язків у молекулі білка, що складається зі 191 амі- нокислотного залишку?​

Answer 1

Ответ:

Давайте розглянемо вправи зі структури білків:

1. Для обчислення кількості амінокислотних залишків в міозині, вам потрібно поділити відносну молекулярну масу білка на середню відносну молекулярну масу одного амінокислотного залишку:

Кількість залишків = (Відносна молекулярна маса білка) / (Середня відносна молекулярна маса амінокислотного залишку)

Кількість залишків = 500,000 / 110 = 4545 амінокислотних залишків.

2. Для обчислення маси і довжини білкового ланцюга пепсину, використовуйте дані про кількість амінокислотних залишків:

Маса білкового ланцюга = (Кількість амінокислотних залишків) × (Середня відносна молекулярна маса амінокислотного залишку)

Маса білкового ланцюга = 340 × 110 = 37,400 а.о.м. (атомних одиниць маси)

Довжина білкового ланцюга = (Кількість амінокислотних залишків) × (Довжина одного амінокислотного залишку)

Довжина білкового ланцюга = 340 × 0,35 нм = 119 нм.

3. Для знаходження кількості можливих послідовностей амінокислотних ланцюгів, вам потрібно враховувати кількість можливих амінокислот і довжину ланцюга. З формули можна знайти кількість варіантів:

Кількість варіантів = (Кількість амінокислот) ^ (Довжина ланцюга)

4. Для обчислення відносної молекулярної маси білка, враховуючи вміст лізину, спершу знайдемо масу лізину в білку, а потім додамо її до маси інших залишків:

Маса лізину = (Відсоток лізину від загальної маси білка) × (Відносна молекулярна маса лізину)

Маса лізину = (5,29% / 100) × 146 = 7,71 а.о.м.

Відносна молекулярна маса білка = (Відсоток лізину від загальної маси білка + Відносна молекулярна маса інших залишків) / (Відсоток лізину від загальної маси білка) = (100% / (100% - 5,29%)) × (500,000 + Маса лізину)

Відносна молекулярна маса білка ≈ (100% / 94,71%) × (500,000 + 7,71) ≈ 528,418 а.о.м.

5. Для знаходження кількості пептидних зв'язків у білку, вам потрібно помножити кількість амінокислотних залишків на 2, оскільки кожен пептидний зв'язок формується між двома амінокислотними залишками:

Кількість пептидних зв'язків = (Кількість амінокислотних залишків) × 2 = 191 × 2 = 382 пептидних зв'язків.

Сподіваюся, це допоможе вам розв'язати вправи зі структури білків.