Question

на что указывает появляющаяся иногда зебровидная окраска жеребят домашних лошадей

Answer 1

Атавизм - редкий случай возврата к признакам предков. 
Гены, отвечающие за эти признаки имеются, но они были блокированы другими генами. По какой-то причине (мутации, образ жизни родителей и тд) блокировка снимается и признак проявляется.
Следовательно, лошади родственны зебрам, по этому идет возврат к их окраске.