Question

как определить падеж имён существительных в словосочетании  лежит в столе?

Answer 1

Нужно задать вопрос к существительному 
лежит (в чём?) в столе - предложный падеж

Answer 2

Надо задать вопрос от главного слова(лежит) к зависимому слову(в столе):
Лежит (в чём?) в столе-предл.падеж.