Question

справедливо ли считать природную зону природным территориальным комплексом?

Answer 1

Да, справедливо, потому что природная зона - это крупный природный комплекс, то есть совокупность природных компонентов, взаимосвязанных между собой, находящихся на определенной территории. 
Разница в том, что природный комплекс можно рассматривать в более большом масштабе. Например, ПК Русской равнины, где будет несколько природных зон и ПК Западно-Сибирской низменности.