Question

почему с помощью микроскопа Нельзя увидеть атом

Answer 1

Увидеть с помощью обычного света нельзя. Потому что размеры атома  меньше длины волны света.
Так что увидеть  атомы можно только с помощью специальных приборов:  туннельный микроскоп или атомно-силовой микроскоп.

Answer 2

потому что длинна волны сильно больше размера атома, свет просто огибает отдельные атомы.
но на электронных микроскопах рассмтреть таки можно. за счет резонансного рентгеновского излучения самого рассматриваемого матриала.